PROGRAMME

Lundi 19 mars 2018 - Ingénierie des ARN et des réseaux biochimiques

08h30 - 08h45 Accueil
08h45 - 09h00 Présentation de l'École Thématique
09h00 - 10h30 Plant and Mammalian Synthetic biology approach for the control and understanding of cellular processes
  Matias ZURBRIGGEN, Inst. of Synthetic Biology, U. of Düsseldorf, D
10h30 - 11h00 Pause
11h00 - 12h30 Engineered riboswitches - an alternative means to control gene expression
  Beatrix SÜß, Dept of Biology, TU Darmstadt, D
12h30 - 14h00 Déjeuner
14h00 - 14h30 Discussions avec les orateurs du jour
14h30 - 16h00 Présentations étudiants (I)
16h00 - 16h30 Pause
16h30 - 18h00 Présentations étudiants (II)
18h00 - 19h30 Séance Posters
20h00 - 21h00 Dîner

Mardi 20 mars 2018 - Méthodes formelles, systèmes dynamiques

09h00 - 10h30 Intrinsic Coarse-Graining of Models of Signalling pathways
  Jérôme FÉRET, Antique team, DI - École Normale Supérieure, Paris, F
10h30 - 11h00 Pause
11h00 - 12h30 Reasoning over large-scale and uncertain systems in biology
  Anne SIEGEL, Dyliss team, IRISA lab., Rennes, F
12h30 - 14h00 Déjeuner
14h00 - 14h30 Discussions avec les orateurs du jour
14h30 - 16h30 Atelier : BIOCHAM
  Francois FAGES, INRIA Saclay, F
16h30 - 17h00 Pause
17h00 - 19h00 Atelier : Simulations Entité-centrée
  Patrick AMAR, Sys2Diag, CNRS / LRI, Univ. Paris-Sud, F
17h00 - 19h00 Atelier : Concepts de base de modélisation mathématique en Python (I)
  Oliver EBENHOEH, Heinrich-Heine University Düsseldorf, D
19h30 - 20h30 Dîner
21h00 - 22h00 Titre à venir.
  Anne CAMBON-THOMSEN, Épidémiologie et analyses en santé publique, INSERM / U. Toulouse, F

Mercredi 21 mars 2018 - Théorie du contrôle - réseaux

09h00 - 10h30 From heterogeneous data of biological systems to quantitative predictive models
  Nicole RADDE, Inst. for Systems Theory and Automatic Control, U. of Stuttgart, D
10h30 - 11h00 Pause
11h00 - 12h30 Cybergenetics: Theory and Tools for Biomolecular Control Systems
  Mustafa KHAMMASH, Department of Biosystems Science and Engineering, ETHZ, Zurich, CH
12h30 - 14h00 Déjeuner
14h00 - 14h30 Discussions avec les orateurs du jour
14h30 - 17h30 Atelier : modélisation du métabolisme (I)
  Jean-Pierre MAZAT, Univ. Bordeaux 2, F
14h30 - 16h30 Atelier : Détecter des régularités dans le génome avec GREAT
  Costas BOUYIOUKOS, Epigenetics and cell fate, Univ Paris-Diderot, F
17h00 - 19h00 Atelier : Concepts de base de modélisation mathématique en Python (II)
  Oliver EBENHOEH, Heinrich-Heine University Düsseldorf, D
18h00 - 19h30 Séance Posters
19h30 - 20h30 Dîner

Jeudi 22 mars 2018 - Modélisation chez la levure

09h00 - 10h30 Mitochondrial to nuclear gene transfer via synthetic evolution
  Jean-Paul DI RAGO, Institut de Biochimie et Génétique Cellulaires, CNRS / U. Bordeaux, F
10h30 - 11h00 Pause
11h00 - 12h30 Stoichiometric constraint-based modelling of the yeast metabolic oscillator
  Douglas MURRAY, Inst. For Advanced Biosciences, Keio U., JP
12h30 - 14h00 Déjeuner
14h00 - 14h30 Discussions avec les orateurs du jour
14h30 - 16h30 Atelier : Approches Logiques
  Gilles BERNOT, I3S, Univ. Nice, F
14h30 - 16h30 Atelier : FindPath et RetroPath: Des solutions pour la conception in silico de voies métaboliques
  Pablo CARBONELL & Stéphanie HEUX, iSSB, Evry, F & Synbiochem, Univ. Manchester, UK and LISBP, INSA Toulouse, F
16h30 - 17h00 Pause
16h15 - 19h15 Atelier : modélisation du métabolisme (II)
  Jean-Pierre MAZAT, Univ. Bordeaux 2, F
17h00 - 19h00 Atelier : Conception de réseaux artificiels de régulation de gènes par une approche "logique floue"
  Morgan MADEC, Telecom Physique Strasbourg, Illkirch, F
19h30 - 21h00 Dîner

Vendredi 23 mars 2018 - Génomique de synthèse et biochimie artificielle

09h00 - 10h30 Building outside biology: new genetic materials, new tools
  Vitor PINHEIRO, London, UK
10h30 - 11h00 Pause
11h00 - 12h30 Synthetic alienation of microbial organisms: why and how?
  Ned BUDISA, Technische Universität Berlin, Institut für Chemie, Berlin, D
12h30 - 13h00 Discussions avec les orateurs du jour